La chiesa fu eretta nel 1626 e portata a compimento nel 1636, grazie all’interessamento di Orazio Giustiniani (membro della congregazione oratoriana fondata da Filippo Neri), e dall’amore e dall’attaccamento della popolazione per San Filippo Neri

Questa chiesetta si trova all’interno del borgo medievale di Carbognano e ha le caratteristiche di chiesa castrale. Fu costruita contestualmente al castello intorno all’XI secolo.

Il culto di sant’Anna è molto praticato in particolare dalle donne di Carbognano, che ad essa si affidavano in vista del parto. Questo culto era molto sentito, soprattutto nei centri rurali, nei quali il parto era un momento molto delicato.